La Direction des systèmes d'information compte plus de 170 agents et est organisée de la manière suivante :
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Des missions à vocation académique :
- un Département Services et Relations Utilisateurs (DSRU)
- un Département Etudes et Ingénieries Logicielles (DEIL)
- un Département Infrastructures et Architectures (DISP)
- mais aussi des équipes de proximité dans les chefs lieu de l'académie :
- Ariège
- Aveyron
- Haute-Garonne
- Gers
- Hautes-Pyrénées
- Lot
- Tarn
- Tarn-et-Garonne
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Des missions à vocation nationale :
- Sur le domaine des SI Ressources Humaines
- le département des développements nationaux
- le pôle diffusion
- le pôle homologation
- Sur les domaines transverses
- le pôle de compétence PNCN (Plateforme Nationale de Confiance Numérique)
- le pôle de compétence FOAD (Formation Ouverte A Distance)
- le pôle de compétence Base de Données
- Sur le domaine des SI Ressources Humaines
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